W latach 80. klub pod nazwą Gwardia działał przy szkole Ministerstwa Spraw Wewnętrznych. Nazwę Legionovia przywrócono klubowi w 1989 roku. Przez krótki czas Legionovia działała przy TKKFie.

Na początku lat 90. w klubie funkcjonowały sekcje piłki nożnej, rugby i szachów. W 1994 roku sekcja rugby usamodzielniła się. W 1996 roku wraz z wejściem w życie przepisów Ustawy o stowarzyszeniach klub przybrał formę stowarzyszenia sportowego pod nazwą Miejski Klub Sportowy Legionovia z sekcjami piłki nożnej, brydża, szachów i piłki siatkowej kobiet. Pod koniec 2003 roku postanowiono o wyłączeniu i usamodzielnieniu sekcji piłki siatkowej, co zbiegło się z awansem drużyny siatkarek do Serii B I ligi. Do innego klubu „przekazano” również sekcję szachową.

Wraz z przeniesieniem siedziby klubu do nowego budynku (w połowie 2003 roku) zarząd klubu podjął decyzję o powołaniu sekcji kulturystyki, przy której uruchomiono klub fitness z siłownią i aerobikiem. Kontynuatorem tradycji i dokonań klubu jest obecnie Stowarzyszenie Sportowe pn. Klub Sportowy Legionovia z możliwością prowadzenia działalności gospodarczej.